蟲害控制是食品工廠必須考慮的重要問題，從廠房車間在設計時就要考慮。建筑完好、環境整潔、廠房車間密封是蟲害控制的基礎。車間與外界想通的人流門、物流門、安全門、窗戶均需采取有效防護措施。有風幕、軟門簾、紗窗紗簾、擋鼠板、滅蠅燈、誘餌站，通風管道、下水道的防護網等。
車間排水設施設計時應該盡量做大且便于清理，大一點浪費不了，小了污水下不去，車間那叫一個亂。不是城市排水系統雨季要經歷考驗，車間的排水也會出現不能及時排出的情況。污水要從高清流向低清，高清盡量使用小型帶蓋明溝加暗溝組合，低清使用帶蓋明溝。地漏應在房間內的最低處，至少要包括粗孔蓋板、過濾網、水封，要具備過濾食品殘渣，防止蟲害入侵的功能。
